1.引言
CRISPR-Cas9技術因其高效、精準的基因編輯能力,已成為構建大鼠基因敲除(KO)模型的首選方法。相較于傳統(tǒng)方法(如ES細胞打靶),CRISPR技術周期短、成本低,適用于大規(guī)?;蚬δ苎芯俊FぶZ飛生物基于多年CRISPR大鼠模型構建經驗,提供從sgRNA設計到表型分析的一站式服務,成功構建超過500種基因敲除大鼠模型,廣泛應用于疾病機制研究、藥物開發(fā)和功能基因組學。
本文將系統(tǒng)介紹CRISPR大鼠基因敲除模型的構建流程、關鍵優(yōu)化點、常見問題及解決方案,并結合皮諾飛生物的特色服務,為研究者提供標準化操作指南。
2.CRISPR大鼠基因敲除模型構建流程
2.1靶點設計與sgRNA優(yōu)化
(1)基因結構分析
-確定目標基因的外顯子區(qū)域(優(yōu)先選擇首個功能域或關鍵外顯子)
-避免脫靶效應:使用CRISPRscan、CHOPCHOP等工具預測sgRNA效率
-皮諾飛生物提供AI輔助sgRNA設計服務,脫靶率<0.1%
(2)sgRNA合成與驗證
|步驟|關鍵參數(shù)|
|sgRNA合成|化學修飾(2'-O-methyl增強穩(wěn)定性)|
|體外驗證|T7E1酶切或Sanger測序檢測切割效率|
|優(yōu)化方案|若效率<60%,需重新設計sgRNA|
2.2胚胎顯微注射與基因編輯
(1)受精卵準備
-選用SD或Wistar大鼠(6-8周齡,SPF級)
-超排卵處理(PMSG+hCG方案)
(2)CRISPR組分注射
-注射方案:
-Cas9mRNA+sgRNA(常用,減少脫靶風險)
-RNP(核糖核蛋白復合物)(編輯效率更高)
-顯微注射參數(shù):
-注射體積:1-2pL/胚胎
-Cas9濃度:50-100ng/μL
(3)胚胎移植
-注射后胚胎培養(yǎng)至2-細胞期
-移植至假孕母鼠(移植存活率>80%)
2.3基因型鑒定與建系
(1)初篩(F0代)
-PCR+測序檢測突變類型(Indel、大片段缺失等)
-TIDE分析計算編輯效率
(2)穩(wěn)定品系建立(F1代)
-篩選雜合子(+/-)進行互配
-Southernblot或長片段PCR驗證純合子(-/-)
3.關鍵優(yōu)化點與常見問題
3.1提高編輯效率的策略
|影響因素|優(yōu)化方案|
|---------|---------|
|sgRNA設計|選擇高GC含量(40-60%)區(qū)域|
|Cas9遞送方式|RNP比質粒更高效|
|胚胎質量|使用新鮮受精卵(<2h內注射)|
3.2常見問題與解決方案
|問題|可能原因|解決方案|
|------|---------|---------|
|低編輯效率|sgRNA設計不佳|重新優(yōu)化sgRNA|
|高嵌合率(F0)|注射時間延遲|使用早期胚胎(原核期)|
|脫靶效應|sgRNA特異性低|選擇高評分sgRNA或使用HiFiCas9|
4.皮諾飛生物特色服務
4.1一站式CRISPR大鼠模型構建
-從設計到表型分析全程服務
-3個月快速交付(傳統(tǒng)方法需6-12個月)
4.2基因編輯質控體系
|檢測項目|方法|
|---------|------|
|脫靶分析|全基因組測序(WGS)|
|表型驗證|WB/qPCR/免疫組化|
4.3典型應用案例
-案例1:構建ApoE敲除大鼠(動脈粥樣硬化研究)
-案例2:IL-10KO大鼠(炎癥性腸病模型)
5.結論
CRISPR技術極大促進了大鼠基因敲除模型的構建效率,但仍需優(yōu)化sgRNA設計、胚胎操作和基因型鑒定等關鍵步驟。皮諾飛生物提供高成功率、低脫靶率的CRISPR大鼠模型構建服務,助力基因功能研究與藥物開發(fā)。
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