實時熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)是一種在DNA擴增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測每次聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析的方法。
第一步:提取核酸樣品
首先,從待檢樣品中提取核酸。提取方法根據(jù)樣品的性質(zhì)可以選擇不同的試劑盒,如常用的基于硅膠膜或磁珠法的核酸提取試劑盒。提取的核酸應(yīng)具有一定的純度和濃度,以保證后續(xù)PCR反應(yīng)的準確性和穩(wěn)定性。
第二步:設(shè)計引物與探針
PCR引物和探針的設(shè)計至關(guān)重要,它們直接影響PCR的特異性和靈敏度。引物應(yīng)具有特異性,避免引物間或引物與非靶序列的雜交,探針則應(yīng)設(shè)計在引物的中間位置,用于檢測PCR產(chǎn)物并發(fā)出熒光信號。在設(shè)計引物和探針時,建議使用專業(yè)的PCR引物設(shè)計軟件,以確保其特異性和穩(wěn)定性。
第三步:制備PCR反應(yīng)體系
根據(jù)實驗需要,合理配置PCR反應(yīng)體系。通常包括DNA模板、引物、探針、DNA聚合酶、緩沖液、dNTPs等。在配置反應(yīng)體系時,應(yīng)盡量避免氣泡產(chǎn)生和樣品交叉污染,保證反應(yīng)體系的穩(wěn)定性和準確性。
第四步:進行實時熒光定量PCR
將制備好的PCR反應(yīng)體系加載至實時熒光定量PCR儀器中,設(shè)置好反應(yīng)程序,進行PCR擴增。實時熒光定量PCR儀器可以實時監(jiān)測PCR產(chǎn)物的累積情況,并生成熒光信號曲線。根據(jù)曲線的特征可以確定靶基因的表達量或拷貝數(shù)。
第五步:數(shù)據(jù)分析與結(jié)果解讀
最后,根據(jù)實時熒光定量PCR儀器輸出的數(shù)據(jù),進行數(shù)據(jù)分析和結(jié)果解讀。常用的分析方法包括計算Ct值、繪制標準曲線、計算樣品中靶基因的相對表達量等。通過合理的數(shù)據(jù)分析,可以準確評估實驗結(jié)果并得出科學(xué)結(jié)論。