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細(xì)胞自噬研究必備!經(jīng)典實驗方法全解析,從原理到操作一文掌握


導(dǎo)語

細(xì)胞自噬(Autophagy)是細(xì)胞通過溶酶體降解受損細(xì)胞器或異常蛋白的“自我清理”機制,在癌癥、神經(jīng)退行性疾病等領(lǐng)域備受關(guān)注。然而,自噬檢測方法多樣且技術(shù)細(xì)節(jié)復(fù)雜,如何選擇并精準(zhǔn)解讀數(shù)據(jù)?本文系統(tǒng)梳理自噬研究的6大經(jīng)典實驗方法,助你避開實驗“雷區(qū)”,高效完成課題!

 

一、WesternBlot檢測LC3蛋白:自噬標(biāo)志物的“金標(biāo)準(zhǔn)”

原理:自噬過程中,胞漿型LC3-I會脂化形成膜結(jié)合型LC3-II,其比值(LC3-II/LC3-I)或LC3-II與內(nèi)參蛋白(如β-actin)的比值可反映自噬水平。

實驗步驟:

1.樣本處理:實驗組需設(shè)置自噬誘導(dǎo)劑(如雷帕霉素)和抑制劑(如氯喹CQ)對照。

2.蛋白提?。毫呀饧?xì)胞后離心取上清,BCA法定量。

3.電泳與轉(zhuǎn)膜:SDS-PAGE分離蛋白,轉(zhuǎn)至PVDF膜。

4.抗體孵育:一抗(抗LC3抗體,如SigmaL7543),二抗(HRP標(biāo)記)。

5.顯影分析:化學(xué)發(fā)光法檢測條帶,計算LC3-II/LC3-I比值。

 

關(guān)鍵提示:

-溶酶體抑制劑必要性:氯喹可阻斷自噬體降解,通過比較“誘導(dǎo)組”和“誘導(dǎo)+抑制組”判斷自噬流(AutophagicFlux)是否完整。

-避免假陽性:某些應(yīng)激(如饑餓)會短暫上調(diào)LC3-II,需結(jié)合其他實驗交叉驗證。

 

二、熒光顯微鏡觀察mRFP-GFP-LC3雙熒光探針法

原理:

-GFP:在酸性環(huán)境(溶酶體)中熒光淬滅;

-mRFP:耐酸性強,熒光穩(wěn)定。

當(dāng)自噬體(中性pH)形成時,顯示黃色斑點(GFP+mRFP疊加);自噬體與溶酶體融合后,GFP信號消失,僅保留紅色斑點。

 

實驗步驟:

1.轉(zhuǎn)染/病毒感染:將mRFP-GFP-LC3質(zhì)粒導(dǎo)入細(xì)胞。

2.藥物處理:誘導(dǎo)或抑制自噬。

3.共聚焦顯微鏡觀察:統(tǒng)計紅黃斑點數(shù)量及比例。

 

結(jié)果判讀:

-黃斑(GFP+/mRFP+):自噬體形成階段;

-紅斑(mRFP+/GFP-):自噬溶酶體階段;

-紅斑增多:自噬流活躍。

 

優(yōu)勢:直觀區(qū)分自噬體與自噬溶酶體,動態(tài)監(jiān)測自噬流。

 

三、透射電鏡(TEM):自噬結(jié)構(gòu)的“終極鑒定”

原理:透射電鏡可清晰觀察到自噬體(雙層膜結(jié)構(gòu)包裹細(xì)胞質(zhì)成分)及自噬溶酶體(單層膜包裹降解物質(zhì))。

實驗流程:

1.樣本固定:2.5%戊二醛+1%鋨酸雙重固定。

2.脫水包埋:梯度乙醇脫水,環(huán)氧樹脂包埋。

3.超薄切片:切片厚度50-70nm,鈾鉛雙染色。

4.電鏡觀察:尋找典型自噬結(jié)構(gòu)并拍照記錄。

 

注意事項:

-自噬體結(jié)構(gòu)易與溶酶體或內(nèi)吞泡混淆,需結(jié)合其他實驗驗證;

-樣本制備耗時,成本較高。

 

四、流式細(xì)胞術(shù):高通量檢測自噬活性

原理:利用熒光探針(如Cyto-ID)特異性標(biāo)記自噬體,通過流式細(xì)胞儀定量分析群體細(xì)胞自噬水平。

操作要點:

1.探針加載:Cyto-ID染料避光孵育細(xì)胞30分鐘。

2.洗滌與分析:PBS洗滌后上機檢測(Ex/Em=480/530nm)。

3.對照設(shè)置:陽性對照(雷帕霉素)、陰性對照(3-MA抑制劑)。

 

優(yōu)勢:快速、高通量,適合藥物篩選或大樣本分析。

 

五、溶酶體功能評估:自噬流的關(guān)鍵驗證

自噬體與溶酶體融合障礙會導(dǎo)致自噬流阻斷,需結(jié)合溶酶體活性檢測:

1.LysoTracker染色:

-原理:LysoTracker(如DND-99)靶向酸性細(xì)胞器(溶酶體)。

-步驟:1μMLysoTracker避光孵育30分鐘,熒光顯微鏡觀察紅色熒光強度。

-意義:溶酶體數(shù)量或活性降低可能提示自噬流受阻。

 

2.組織蛋白酶(Cathepsin)活性檢測:

-方法:使用熒光底物(如MagicRedCathepsinB試劑)檢測酶活性。

-結(jié)果:熒光強度降低表明溶酶體功能異常。

 

六、自噬相關(guān)基因/蛋白的分子調(diào)控

1.關(guān)鍵基因敲除/過表達:

-靶點:ATG5、ATG7、Beclin1等自噬核心基因。

-方法:CRISPR/Cas9、siRNA干擾或質(zhì)粒轉(zhuǎn)染。

2.信號通路檢測:

-mTOR通路:檢測p-mTOR(S2448)水平,mTOR抑制促進自噬。

-AMPK通路:p-AMPK(T172)激活可誘導(dǎo)自噬。

 

實驗設(shè)計避坑指南

1.自噬流檢測必不可少:單獨檢測LC3-II可能誤判,需結(jié)合抑制劑明確自噬活性。

2.多方法聯(lián)用:WesternBlot+熒光顯微鏡+電鏡組合提高結(jié)論可靠性。

3.關(guān)注細(xì)胞類型差異:不同細(xì)胞系基礎(chǔ)自噬水平差異大,需預(yù)實驗優(yōu)化條件。

 

結(jié)語

細(xì)胞自噬研究既是熱點也是難點,從方法選擇到數(shù)據(jù)解讀均需嚴(yán)謹(jǐn)設(shè)計。皮諾飛生物提供自噬研究全方案支持,包括:

-LC3/ATG抗體:高特異性,低背景;

-自噬誘導(dǎo)/抑制劑:氯喹、雷帕霉素等現(xiàn)貨供應(yīng);

-一站式檢測服務(wù):電鏡切片、流式分析、熒光染色。

 

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